Quando Scarlett e Snake Eyes se infiltram nas instalações secretas do Comandante Cobra, eles descobrem que o Comandante Cobra está escondido nas instalações após um ataque ninja em sua própria casa. A ameaça do ninja faz com que a Baronesa chame Storm Shadow para proteger o Comandante Cobra. Logo é descoberto que o ninja é na verdade Jinx em um traje de alta tecnologia feito por Destro’s M.A.R.S. Industries e ela descobre o que realmente aconteceu no dia em que o Hard Master foi morto. Storm Shadow também confessa a verdade para ela e agora não tem mestre quando deixa Jinx para ser o líder legítimo do clã Arashikage. Ela jura que a partir de agora o clã seguirá o caminho que seu pai pretendia – abandonar os velhos hábitos e abraçar o novo – usando tecnologia.