O Dr. Nuvo Vindi é preso, mas o vírus infecta Rex, Padmé, Ahsoka e outros clones. Eles terão que impedir que os dróides restantes escapem, e Obi-Wan e Anakin terão que ir a Yego, um planeta amaldiçoado para conseguirem a cura do Vírus Azul. O planeta é amaldiçoado pelo fantasma de Dron, antigo governador do planeta, e terão que voltar a Naboo antes que Ahsoka, Rex, Padmé e os clones morram por causa do vírus.